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優(yōu)質(zhì)的烘豆雖然重要，但如何完善保存豆子更是一個(gè)關(guān)鍵的問(wèn)題。咖啡也是一種食物，因此須好好保存以確認(rèn)其狀態(tài)安定、不會(huì)變質(zhì)。雖然很多國(guó)家法律上規(guī)定咖啡豆的有效期限是1年，但事實(shí)上豆子的保存與咖啡豆內(nèi)部氣體流失的時(shí)期有關(guān)。大致上來(lái)說(shuō)，由愈大臺(tái)烘豆機(jī)所烘出的豆子，排放出氣體的時(shí)間就愈長(zhǎng)，保存時(shí)間也較長(zhǎng)；而烘豆機(jī)愈小，烘出的豆子賞味期限也愈短。從烘焙容量30公斤以下的烘豆機(jī)所烘出的豆子，通常會(huì)認(rèn)為要在1個(gè)月內(nèi)使用完較好。若咖啡豆的脂肪成份氧化，產(chǎn)生像是食用油酸掉或煙灰般的味道時(shí)，就不要在食用了。
以未磨碎的狀態(tài)來(lái)保存咖啡豆
咖啡從磨碎的那瞬間起，其所帶有的香氣粒子便會(huì)開(kāi)始快速向空中逸散，因此在磨碎后，即使只經(jīng)過(guò)較短的時(shí)間，也會(huì)有大量香氣飄散出去。所以若將咖啡豆磨成粉后保存的話，會(huì)發(fā)現(xiàn)義式濃縮咖啡機(jī)旁邊都會(huì)有一臺(tái)磨豆機(jī)，這就是為了要盡量保存咖啡的香氣，在一磨好咖啡粉后就馬上進(jìn)行萃取，讓咖啡香盡可能地融入咖啡中。
保存在沒(méi)有濕氣的地方
烘豆完畢的豆子水分含量通常在1～2％之間，若天氣潮濕時(shí)便會(huì)吸入水分，吸收的水分就會(huì)對(duì)咖啡產(chǎn)生影響。這種現(xiàn)象被稱為“非意料中的提前萃取”，會(huì)使咖啡的香氣快速變質(zhì)，且產(chǎn)生不好的氣味。
使用密封的容器或包裝
雖然說(shuō)烘好的咖啡豆因?yàn)楹可?，所以不?huì)腐壞。但另一方面，因?yàn)榭Х仁欠N子作物，所以含有相當(dāng)高含量的脂肪質(zhì)，若和氧氣接觸的話，就會(huì)開(kāi)始發(fā)酸腐敗。因此盡量使用能隔絕氧氣的密閉式容器較好。在保存咖啡時(shí)，最重要的便是隔絕光線及外部的空氣?；谶@個(gè)原因，裝咖啡的袋子幾乎大部分都鍍了鋁，使袋子能阻隔空氣及防止光線透入。
最好的保存方式便是使用鍍錫罐頭來(lái)保存咖啡。但去到大部分的咖啡專賣店會(huì)發(fā)現(xiàn)，很多店家都是使用透明的密封瓶來(lái)保存咖啡。這是基于陳列的考量，因?yàn)榈昙冶仨氁獙⒖Х日故境鰜?lái)才賣得出去。而這類咖啡店的咖啡通常很快就被賣出去了，所以因保存失當(dāng)而產(chǎn)生不好味道的可能性可以說(shuō)極小。
保存在室溫10～20度C較好
咖啡在室溫中味道變質(zhì)之前，快點(diǎn)消耗完比較好。不過(guò)，如果是在不得已的情況下保存大量咖啡，且在發(fā)酸之前用不完的話，把咖啡放進(jìn)冰箱保存也是一個(gè)方法。
但一般的冰箱會(huì)同時(shí)存放有其他的食物，因此若將咖啡與食物們放在一起的話，咖啡可能會(huì)吸收這些氣味，因此不太建議這么做。若非不得已一定存放在冷藏的話，使用能完全密封的容器會(huì)較好。
冷凍的話可以保存得更久些，但還是有許多必須要注意的地方。從冷凍庫(kù)拿出來(lái)后，如果馬上就開(kāi)封的話，因?yàn)闇夭畹年P(guān)系，豆子表面會(huì)凝結(jié)濕氣。因此從冷凍庫(kù)中取出存放的豆子后，如果馬上就打開(kāi)來(lái)倒出想要的量，然后再次把豆子放回冷凍庫(kù)，反覆進(jìn)行幾次這樣的動(dòng)作的話，就會(huì)讓豆子產(chǎn)生煙灰氣味般不好的味道。
從冷凍庫(kù)拿出咖啡后，先不要開(kāi)封，在室溫中放置1～2個(gè)小時(shí)后，等豆子的溫度回溫到跟室溫差不多時(shí)，再萃取咖啡?；蚴孪葘⒁淮我鹊姆萘垦b在小夾鏈袋中保存也是一個(gè)方法。
